Въведение
Биоинформатиката е интердисциплинарна наука в интерфейсите на биологичните, информационните и изчислителните науки, използва изчисления за по-добро разбиране на биологията. Биоинформатиката включва анализ на биологични данни, по-специално ДНК, РНК и протеинови последователности. Полето на биоинформатиката е изпитало експлозивен растеж от средата на 90-те години на миналия век, задвижван главно от проекта за човешкия геном и от бързия напредък в технологията за секвениране на ДНК. Съвременните и нови технологии произвеждат биологични набори от данни с все по-голяма резолюция, които разкриват не само геномни последователности, но и изобилие от РНК и протеини, взаимодействията помежду си, тяхната субцелекулна локализация и идентичността и изобилието на други биологични молекули. Това изисква разработването и прилагането на сложни изчислителни методи. Биоинформатиката използва изчислителни подходи за анализиране на моделите в биологичните данни и за създаване на сложни модели на биологична активност, включително опити за изясняване на функциите на гените и техните взаимодействия в генетичните Pathways . Широко разпространени социални ползи се очакват от използването на богатството от нови знания относно генетичните механизми на живота и свързаните с тях процеси.
Анализите в биоинформатиката се фокусират главно върху три типа големи масиви от данни, налични в молекулярната биология: макромолекулни структури, геномни последователности и резултати от функционални геномни експерименти (напр. Данни за експресията). Допълнителната информация включва текста на научните статии и "данни за връзката" от метаболитните Pathways , таксономичните дървета и мрежите за взаимодействие протеин-протеин. Биоинформатиката използва широк спектър от изчислителни техники, включващи последователност и структурно подравняване, дизайн на база данни и извличане на данни, макромолекулна геометрия, филогенетично дърво, прогнозиране на протеинова структура и функция, генно откриване и клъстериране на данни за изразяване. Акцентът е върху подходите, включващи различни изчислителни методи и хетерогенни източници на данни.
Основната цел на докторската програма по биоинформатика в международния кампус на Киш е да обучи следващото поколение компютърни биолози за кариера в академичните среди, индустрията и правителството.
Докторантура
Дисциплината "Биоинформатика" изисква завършване на 32 кредита, набор от основни курсове (9 кредита), семинар (1 кредит) и 8 кредита от избираеми дисциплини и докторска дисертация (18 кредита). Основният акцент на програмата е върху успешното завършване на оригинален и независим изследователски проект, написан и защитен като дисертация.
Изчерпателен изпит
Комплексен изпит трябва да се вземе най-много в края на четвъртия семестър и се изисква преди студентът да защити предложението за докторантура. Студентите ще имат два шанса да преминат докторския изпит. Ако студентите получат оценка за "незадоволително" при първия им опитен изпит, студентът може да повтори квалификатора веднъж. Вторият провал ще доведе до прекратяване на програмата. Изчерпателният изпит има за цел да гарантира, че студентът ще започне рано да придобива опит в областта на научните изследвания; тя също така гарантира, че студентът има потенциал да провежда научни изследвания на докторско ниво.
ПРЕДЛОЖЕНИЕ ЗА ПРЕПОДАВАТЕЛИ
Предложението за докторантура трябва да съдържа конкретни цели, научноизследователски проекти и методи и предложение за работа и времева рамка. Освен това предложението трябва да съдържа и библиография и, като прикачени файлове, всички публикации / допълнителни материали. Студентът трябва да защити предложението си за теза на своя комитет в устния изпит.
ТЕЗА
Студентът трябва да избере съветник по дисертации (и един или двама съ-съветници, ако е необходимо) в рамките на първата година от докторантурата, одобрена от факултетния комитет. През втората година комисия по тезата, предложена от съветника заедно с предложението за докторантура, трябва да бъде предадена за одобрение. Дипломната комисия трябва да се състои от минимум пет членове на факултета. Двама членове на комисията по теми трябва да бъдат от другите университети на ниво доцент. Не по-късно от края на 5-ти семестър, студентът трябва да представи и защити писмено докторантура.
НАУЧНИ ИЗСЛЕДВАНИЯ
Очаква се студентът да се срещне с неговата / нейната теза комисия най-малко веднъж годишно, за да прегледа напредъка в научните изследвания. В началото на всяка университетска календарна година всеки студент и съветник на студентите трябва да представят оценка за напредъка на студентите, като очертават постиженията и плановете през изминалата година за текущата година. Дипломната комисия разглежда тези резюмета и изпраща на студента писмо, обобщаващо техния статус в програмата. Учениците, които не успяват да постигнат задоволителен напредък, се очаква да коригират всички недостатъци и да преминат към следващия етап в рамките на една година. Ако не го направите, това ще доведе до отпадане от програмата.
Докторска дисертация
В рамките на 4 години след влизането си в докторската програма студентът се очаква да завърши изследването на тезата; студентът трябва да има резултатите от изследването, които са приети или публикувани в списания с рецензии. При представяне на писмена дисертация и обществена защита и одобрение от комисията студентът получава дипломна степен. Защитата ще се състои от (1) представяне на дисертацията от завършил студент, (2) разпит от широката аудитория и (3) разпит от затворен тип от дисертационния комитет. Студентът ще бъде информиран за резултата от изпита при завършване на трите части на защитата на дисертацията. Всички членове на комисията трябва да подпишат заключителния доклад на докторската комисия и окончателната версия на дисертацията.
За дипломирането трябва да се поддържа минимална СОП от 16 над 20 години.
Курсове за изравняване (не се прилагат към степента)
Докторатът по биоинформатика придобива магистърска степен по сродни области. Въпреки това, студентите, притежаващи други магистърски степени освен, ще трябва да завършат няколко от следните курсове за изравняване, които са предназначени да осигурят фон за докторски дисциплини. Тези курсове за изравняване не се отчитат за завършване на докторантура по биоинформатика.
Курсове за изравняване: Необходими са най-много 3 курса; 6 кредита

Основни курсове: 4 курса са необходими; 10 кредита

Избираеми дисциплини: 4 задължителни курса, 8 кредита

Описание на курса
Разширена биоинформатика
Алгоритми в биоинформатиката
Структурна биоинформатика
Компютърна геномика
Метаболитно моделиране
Моделиране в системната биология
Разширено извличане на данни
Машинно обучение
Компютърно подпомаган дизайн на лекарства
Program taught in:
See 10 more programs offered by University of Tehran, Kish International Campus »